虽然M3双门轿跑车外形优雅、华丽，但是客户仍然觉得有改进的空间。因此，要求M3敞篷车的呼声大作。与此同时，宝马公司下属子公司motor sport更名为M GmbH，该子公司预计到了客户希望推出敞篷车的需求而相应的提出了设计生产方案。
1994年，基于3系4座敞篷车的新款敞篷M3问世了，标配动力顶罩，并注入了创新安全科技元素。BMW的翻车保护系统为敞篷车乘坐者提供了前所未有的安全保护。该车前挡框架极其坚固，后座头靠处装有两只翻车保护杆，二者结合，在汽车发生意外翻滚的情况下为乘客提供保护。该车配有专门的传感器监控车体的运行姿态，并在达到警戒值时自动启动翻车保护杆的锁定功能。翻车保护杆由弹簧装置弹出，而不是气体膨胀装置。BMW M3敞篷轿跑车还配备了升级版的动力装置，虽然动力强劲，但不会影响车辆的可控性。该车较M3 双门轿跑车重了80多千克，但这丝毫没有影响到其性能的发挥：0-100公里/小时加速需6.2秒，最高车速与M3 双门轿跑车相同(自动电子限速到250公里/小时)。截至1999年停产，共有12,114辆BMW M3 敞篷轿跑车下线售出。
1994年，宝马公司还有一款4门轿车亮相。当时有为数不少的顾客认为BMW M3 敞篷轿跑车和双门轿跑车过于运动化，他们希望得到一款既具有跑车的高性能，又以体积适中、装饰豪华为特征的宝马轿车。该4门跑车正好迎合了顾客的急切需求，成为了M3系列中运动性能和日常民用特征的完美结合。驾驶该车的感觉与驾驶双门轿跑车无异，但其内部标准配件尽显高档，使用了高档木质装饰板和Nappa软皮座椅。该车的销售数量足以说明它是多么的成功：截至1999年，该车共售出12,435辆。
1995年春，BMW M GmbH发行了一款数量不多的限量版M3跑车—BMW M3 GT 双门轿跑车，用以参加美国IMSA GT联赛。驾驶员们都希望通过BMW M3 GT双门轿跑车将M3车型的性能发挥到极致。于是，BMW M3原本已经十分强大的动力再次得到了提升。升级后的6缸3.0升引擎最大输出功率217千瓦/295马力，0-100公里/小时加速仅需5.9秒。车身的空气动力学设计再次得到改进，配有前后扰流板。该车最突出的特点在于，其前扰流板的角度可以由驾驶员调整。从汽车配置角度考虑，BMW M3 GT双门轿跑车绝对是里程碑式的极品赛车。此外，该车标配双安全气囊， Nappa软皮运动座椅和碳纤维内饰。该车型属限量版350系列，仅有英国赛车绿一种颜色，售价91,000德国马克。
