南普陀寺位于市区五老峰下，是闽南乃至全国闻名的寺院，紧临厦门大学，背依秀奇群峰，面临碧澄海港，风景绝佳。南普陀寺起源于唐代，荟集了闽南渊源流长的历史文化，有“千年古刹之称”，由入厦始祖南陈族人所建，大雄宝殿石柱上有副对联：“经始溯唐与开元而并古，普光被厦岛对太武以增辉”即为证。五代时，称泗洲院，宋初叫无尽岩，后改名普照寺、普照院，元代至正年(公元1341)被毁；明朝洪武元年(公元1368年)重建；明代永乐年间(1403-1424年)重修，明末(1628年)毁于兵火。清康熙二十三年(1684年)，靖海侯施琅将军重建，因与浙江舟山普陀山普济寺同祀观音菩萨为主，又地处普陀山之南，故称南普陀寺。

　　南普院寺规模宏大，总占地25.8公倾，建筑面积21270平方米。从南到北主轴有天王殿、大雄宝殿、大悲殿和藏经阁四座，加上左右庑廊，钟楼、鼓楼、功德楼、海会楼、普照楼、太虚图书馆、佛学院教室、养正院等。所有这些建筑依傍山势，层层托高，庄严肃穆。近些年来，在天王殿南面有放生池、两个凉亭以及荷花池等，在两池之间有七座由释迦牟尼佛、迦叶佛等七尊佛像组成的七佛塔，万寿塔高11层，富有南亚佛教建筑的风格，使南普陀寺风景更加美丽。

　　天王殿

　　也称弥勒殿，弥勒佛慈眉笑眼，耳垂双肩，袒胸露脐，笑容可掬，似乎对每一位游客都表示恭候光临。

　　弥勒佛在印度是一尊头戴王冠、身体不胖的坐像，而在我国则成了手拿布袋体貌肥壮的五代后梁时的契此和尚。据说他云游各地，无忧无虑，自由自在，人们怎么逗他，他总是眉开眼笑、和善待人。后来他在岳林寺磐石坐化，口中念念有词：“弥勒真弥勒，分身千百亿，时时示世人，世人不自识”。

　　天王殿两侧是魁梧高大、英俊威武的四大天王。全身显得金碧辉煌。屋顶的剪瓷艺术，耐人欣赏。

　　天王殿后面，弥勒佛身后是佛教中的护法神——韦驮，其面朝大雄宝殿的释迦牟尼，身着甲胄，手持降魔金刚杵，意为保护佛祖。传说如果韦驮手持着地金刚杵，表示寺庙是子孙庙，对外来云游僧不开放，至多只能在寺中吃两餐，不得留宿；假如金刚杵是横放在韦驮的手臂上，表示寺庙是十方丛林，游僧可免费食宿；若韦驮左手卡腰，右手我金刚杵过额就说明这寺庙对游僧要适当收费。南普院寺现在是十方丛林的寺规，尽管韦驮的金刚杵是着地，云游僧人是可以免费食宿的。

　　钟楼与鼓楼

　　始建于1921年，后被台风吹倒，是后来重建的。左右分别伽蓝殿和地藏殿，分别供奉伽蓝神和地藏王菩萨。

　　报恩塔

　　大雄宝殿前面的两个报恩塔，是1992年6月13日由信女李秀玲捐献，方丈妙湛法师监制的，佛教讲究报三宝恩、报国家恩、报父母恩、报众生恩，所以，这两个塔命名为报恩塔。

　　大雄宝殿

　　位于天王殿之后，是全寺最宏伟的建筑，是转逢和尚于1932年重建的，是一座重檐歇山顶两层蹿角式的建筑，绿瓦石柱，雕梁画栋，屋上铺琉璃瓦，殿顶绘有九鲤化龙、麒麟奔走、龙凤呈样等磁画，色彩鲜丽，金碧辉煌，庄严肃穆。主要供奉过去、现在、未来“三世尊佛”，中间是释迦牟尼佛，东边是药师佛，西边是阿弥陀佛。

　　释迦牟尼佛两旁，还有两位尊者，东边是大弟子迦叶尊者，西边是堂弟阿难陀尊者，前面是千手千眼观音。民间传说：古时有个老人，养了三个女儿，一天老人病了，需要人眼做药引子。大女和二女都不管，而小女自愿献出自己的眼睛，治好老人的病。此事感动了释迦牟尼，便创造了一个千手千眼观音来纪念她，并让她站在自己的面前。

　　大雄宝殿建筑，体现了“闽南佛殿”四大特点：一、墙上有“清影摇风”、“楚江秋吟”等山水花鸟画，和“神河沐浴”、“六年苦行”等释迦牟尼诞生故事的连环画。二、屋脊是弯月起翘、紫燕凌空，显得轻巧灵动。三、构造精巧，技艺讲究，屋脊嵌有“九鲤化龙”、“麒麟奔走”、“凤凰展翅”等图案，都是剪瓷镶嵌而成。四、建筑材料取材本地花岗岩、青斗石，所有梁、柱、础、斗拱、栏干都独具特色。

　　大悲殿

　　位于大雄宝殿之后，是寺内最有特色的建筑。大悲殿是明代惠安王益顺设计的，建于清初，被火焚烧。1930年太虚和尚重建，1962年重修。大悲殿是一座八角亭式建筑，顶部三重飞檐，由下向上逐层向内收缩，每层檐顶都是八角形，角上雕着龙尾，全以斗拱架叠建成，殿内藻井，全用木料斗拱，不用一支铁钉，仰视藻井，别致美丽。殿顶正中立一葫芦宝塔，塔顶两边雕着龙头，整座建筑，如龙腾空。

　　大悲殿内奉祀观音，其余三面为48臂观音，掌中各雕一只手眼。手上持多种法器，姿态不一，各臻其妙。

　　藏经阁

　　藏经阁为两层文物楼。建于1936年。楼下是法堂，是僧人讲经说法的地方悬挂着四幅古代虞旁的真迹墨宝，是十分珍贵的书法艺术作品。

　　二楼是玉佛宝殿，有缅甸玉佛28尊，神态自如，姿势各异，且用缅甸玉石雕凿而成，精美绝伦。阁内珍藏中外佛典经书数万卷，其中较为珍贵的有宋代《碛砂藏经》，明代《大藏经》、《佛说阿弥陀经》、血书《妙法莲花经》、《日本大藏经》等，还有唐代铜佛、宋代铜塔、明代观音菩萨施甘露像，以及高僧大德的墨宝。

　　闽南佛学院

　　1924年，南普陀寺由临济宗转逢和尚改为十方丛林选贤制，会泉法师任第一任方丈。寺内有1925年创办的为国内最早的佛教学府--闽南佛学院，是弘扬佛法，培养佛家弟子的摇篮。

　　目前该院有男女学僧400多人。1934年，弘一法师又增办佛教养正院，迎来了南普陀寺建寺以来前所未有的兴旺时期。1937年，佛学院因抗战而停办。十几年间佛学院共培养学生200余人，不少人为马来西亚、新加坡、菲律宾等东南亚国家的佛教事业做出巨大贡献。1985年，佛学院重新办学，现设养正院、预科班、正科班，各为两年制，1992年起又增设二年研究班，在国内及东南亚地区有着广泛的影响。南普陀寺与厦门大学仅一墙之隔，却两种意境；古朴与摩登并存，小和尚和大学生为邻。